Caronte venne scoperto nel 1978 da Jim Christy. Prima di allora si pensava che Plutone fosse molto più grande, giacché le immagini di Caronte e Plutone erano confuse insieme.

La particolarità di Caronte è che si tratta del satellite più grande, in rapporto al suo pianeta, del sistema solare (un primato che un tempo era detenuto dalla nostra Luna).
Alcuni preferiscono considerare Plutone/Caronte come un pianeta doppio, piuttosto che un pianeta e un satellite.
Plutone e Caronte sono unici anche per un altro motivo: non solo Caronte ruota in maniera sincrona, ma lo fa anche Plutone: entrambi rivolgono sempre la stessa faccia verso l'altro.