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Die Pflanzen- und Tierwelt ist sehr vielfältig. In den sandigen Küstenregionen findet man die typische Wüstenvegetation mit Sträuchern, Gräser und Knollenpflanzen, während in den Wäldern eine ungeheure Vielzahl von Mahagonibäume, Zedern, Kautschukbäume, Chinarindenbäume, Kräuter- und Vanillepflanzen sowie eine große Vielfalt anderer tropischer Gewächse zu finden ist. In den Küstenregionen und auf den vorgelagerten Inseln leben Möwen, Pelikane, Seeschwalben in der Bergregion auch Kondore, sowie Reptilien wie Eidechsen und Skorpione. In der Sierra leben Lamas, Alpakas, Chinchillas und Guanakos verbreitet. In den Bergregionen leben Pumas, Andenhirsche, weißschwänzige Rehe, Stinktiere und Andenfüchse. In den Urwälder findet man Jaguare, Pumas, Gürteltiere, Pekaris, Ameisenbären, einige verschiedene Affenarten und Reptilien wie Alligatoren, Schildkröten und eine Vielfalt von Schlangen. Die Küstengewässer sind Lebensraum zahlreicher Fischarten wie Seezungen, Sardinen, Schellfischen, Makrelen, Hummern und Garnelen.
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